O Centro de Restauração Ecológica (CRE) atua na coordenação, promoção, análise, acompanhamento, planejamento e execução de programas e projetos de restauração ecológica, visando ao restabelecimento de processos ecológicos, bem como ao incremento da conectividade da paisagem. Também é atribuição do CRE contribuir para o desenvolvimento e a difusão de normas e de metodologias de restauração ecológica, nas diferentes formações vegetacionais ocorrentes no Estado de São Paulo.